Ngoài ra, nội dung và hình thức của các tạp chí có chất lượng không đồng đều. Trong số 12 tạp chí, chưa có tạp chí nào đạt mức chất lượng quốc tế để được ISI công nhận. Hoạt động của Hội đồng biên tập, tiềm lực cán bộ, cơ sở vật chất còn nhiều bất cập, khiến cho chất lượng của các tạp chí còn nhiều hạn chế. Viện KH&CN cũng đã thực hiện một số giải pháp để nâng cao chất lượng của các tạp chí như: Nâng cao chất lượng nội dung bằng cách thu hút các bài báo chất lượng chuyên môn cao, đặc biệt là bài báo của các chuyên gia quốc tế giỏi; nâng cao chất lượng hình thức bằng việc rà soát lại định dạng và hình thức, tiêu chí chất lượng trình bày thống nhất của các bài báo, cung cấp thông tin hướng dẫn chi tiết đến các tác giả; hoàn thiện và tăng cường nhân sự của Hội đồng biên tập, cụ thể là tăng cường các nhà khoa học nước ngoài tham gia Hội đồng biên tập; hoàn thiện cơ chế, chính sách; tăng cường kinh phí, cơ sở vật chất, đào tạo nâng cao năng lực; tăng cường phát hành, quảng bá; mở rộng hợp tác quốc tế.

 Dự kiến đến năm 2014, Viện KH&CN Việt Nam sẽ tổ chức thực hiện thành công 3 đề án nâng cấp xuất bản 3 tạp chí đạt chuẩn quốc tế, xem xét và lựa chọn thêm 1-2 tạp chí khác để thực hiện trong các năm tiếp theo, xuất bản thêm 1-2 tạp chí mới khi hội đủ các điều kiện.